Foram registradas 101 espécies de anfíbios, distribuídos nas ordens anura (7 famílias e 100 espécies) e caudata(uma família e uma espécie). Quanto aos répteis, foram encontradas 40 espécies pertencentes às ordens squamata, crocodilia e chelonia.Dentre as espécies de répteis encontradas destacam-se duas consideradas ameaçadas de extinção: Geochelone denticulata (jabuti)e caiman crocodilus(jacaretinga).